Kitab yang dikaji:
| Ma`had Ula |
| Shorof Kaelani | Jurumiyyah | Imrithi |
| Bidayatul Hidayah | Tafsir Yaasiin | Tizan |
| Ta`lim Muta`alim | Uqudulujen | Yaqulu |
| Hidayatul Mustafid | Jazariyyah | Safinah |
| Sulam At Taufiq | Usfhuriyyah | |
| Ma`had Tsani |
| Alfiyyah Ibnu Malik | Shorof Kaelani | Jurumiyyah |
| Bidayatul Hidayah | Sulam At Taufiq | Tarsif |
| Ta`lim Muta`alim | Uqudulujen | Imrithi |
| Hidayatul Mustafid | Jazariyyah | Usfhuriyyah |
| Tafsir Yaasiin | Yaqulu | Safinah |
| Duroh An Nasihin | | |
| Ma`had `Aliyy |
| Alfiyyah Ibnu Malik | Tafsir Jalalen | Bukhori |
| Minhaajul `Aabidin | I`anah Ath Tholibin | Bajuri |
| Ta`lim Muta`alim | Bidayatul Hidayah | Hikam |
| Duroh An Nasihin | Sulamunairen | Jazariyyah |
| Sulam Mantiq | Rohbiyyah | Uqudulujen |
Program Pengajian:
| Program Mingguan |
| Malam Selasa II & IV | Pengetahuan Umum |
| Rabu Sore | Bidayatul Hidayah dan Uqudulujen |
| Kamis Sore | Ta`lim Muta`allim |
| Malam Sabtu | Rohbiyyah dan Sulamunairen (MA) |
| Malam Ahad dan Selasa | Bukhori dan Minhaajul `Aabidin (MA) |
| Malam Senin | Sulam Mantiq (MA) |
| Malam Jum`at | Riyadloh Umum dan Kegiatan Asrama |
| Jum`at Pagi | Riyadloh Khusus, Kebersihan dan Olah Raga |
| Ahad Pagi | Kuliah Shubuh, Bathtsul Masa`il dan Kebersihan |
| Program Bulanan |
| Malam Rabu Pertama | Tarbiyyatul Muballighin |
| Malam Rabu Ke-Dua | Tarbiyyatul Muballighoh |
| Malam Rabu Ke-Tiga | Peksian |
| Malam Rabu Ke-Empat | Peksian |
| Program Tahunan |
| 17 Sya`ban .s.d. 17 Romadlon | Pengajian Al Fiyyah Tahunan Warga Santri Al Munawwar (Patwa Salwa) dengan kitab pokok Nahwu dan Shorof serta Kitab Faroidh, Kitab Sulamunairen dan Kitab Taqribul Maqshod. |
| Program Umum |
| Reuni Alumni (Ikasalwa – Ikatan Alumni Santri Al Munawwar) | Setiap Tgl. 25 Syawwal |
| Majelis Ta`lim Ibu -Ibu | Setiap Jum`at Sore |
| Majelis Ta`lim Bapak – Bapak | Setiap Malam Selasa II & IV |
| Pegajian Muda Mudi (Ikmal – Ikatan Muda Mudi Al Munawwar) | Setiap Malam Kamis |
| Pengajian Anak-Anak (Iksan Prima – Ikatan Santri Pribumi Al Munawwar) | Setiap Ba`da Maghrib |
| Zaula Salwa (Ziarah Auliya Santri Al Munawwar) | Setiap Akhir Bulan Jumadil Akhir |
| PSAA ( Panti Sosial Asuhan Anak) | Program makan gratis bagi setiap santri yang tidak mampu |
Catatan :
Bagi santri baru disediakan pendidikan khusus dalam jangka waktu yang ditentukan.
